為了從根本上解決農產品質量安全問題，2001年 4月，農業部啟動了《無公害食品行動計劃》，有力地推動了我國農產品質量安全工作的全面開展，農產品質量安全標準、檢測檢驗和認證體系建設取得了極大進展,但從總體上農產品質量安全問題仍然突出。 目前農產品生產經營管理主要仍沿襲計劃經濟時代的模式，農工商分離，產加銷脫節。 農產品質量安全管理權限分散在農業、貿易、工商、環保、衛生等不同部門，都依據相應的工作職能和行業法規，各自進行農產品質量安全管理、檢測。 這種多頭管理的現象導致部門職責不清，主體責任難以落實，管理脫節，不利于農產品質量安全管理工作正常開展。 同時，目前仍缺少對政府管制進行成本效益分析的制度化措施。

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